Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VegfaQ00731 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms