Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax8Q00288 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms