Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pou1f1Q00286 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pou1f1Q00286 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms