Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cry1P97784 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cry1P97784 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cry1P97784 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cry1P97784 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cry1P97784 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cry1P97784 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms