Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcc1P97496 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcc1P97496 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms