Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmklr1P97468 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms