Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas2P97460 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas2P97460 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms