Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas1P97459 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Npas1P97459 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Npas1P97459 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Npas1P97459 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Npas1P97459 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Npas1P97459 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Npas1P97459 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Npas1P97459 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Npas1P97459 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Npas1P97459 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Npas1P97459 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas1P97459 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas1P97459 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Npas1P97459 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Npas1P97459 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Npas1P97459 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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