Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms