Protein–RNA interactions for Protein: P97304

Polr1d, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1dP97304 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1dP97304 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1dP97304 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms