Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms