Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H3f3aP84244 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H3f3aP84244 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms