Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf1P84078 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf1P84078 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arf1P84078 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms