Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubg1P83887 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms