Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcaP82350 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgcaP82350 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcaP82350 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcaP82350 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcaP82350 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcaP82350 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcaP82350 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcaP82350 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcaP82350 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcaP82350 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcaP82350 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SgcaP82350 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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