Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgcdP82347 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgcdP82347 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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