Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx3P81067 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx3P81067 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx3P81067 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx3P81067 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx3P81067 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx3P81067 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx3P81067 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms