Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct7P80313 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cct7P80313 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cct7P80313 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cct7P80313 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cct7P80313 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms