Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx1P80205 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx1P80205 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms