Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ldb1P70662 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ldb1P70662 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms