Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tp53bp1P70399 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms