Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad50P70388 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad50P70388 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rad50P70388 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rad50P70388 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rad50P70388 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rad50P70388 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rad50P70388 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rad50P70388 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad50P70388 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rad50P70388 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad50P70388 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad50P70388 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad50P70388 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad50P70388 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad50P70388 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad50P70388 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad50P70388 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad50P70388 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad50P70388 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad50P70388 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rad50P70388 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rad50P70388 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rad50P70388 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad50P70388 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad50P70388 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad50P70388 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad50P70388 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad50P70388 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad50P70388 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad50P70388 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad50P70388 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rad50P70388 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rad50P70388 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms