Protein–RNA interactions for Protein: P70348

Gcm1, Chorion-specific transcription factor GCMa, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm1P70348 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gcm1P70348 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gcm1P70348 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcm1P70348 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcm1P70348 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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