Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad1P70340 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad1P70340 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms