Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxna3P70208 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxna3P70208 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxna3P70208 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxna3P70208 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxna3P70208 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Plxna3P70208 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plxna3P70208 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plxna3P70208 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plxna3P70208 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Plxna3P70208 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plxna3P70208 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms