Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Abcc9P70170 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Abcc9P70170 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms