Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn5P68500 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn5P68500 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms