Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb4bP68372 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubb4bP68372 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms