Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acta1P68134 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acta1P68134 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acta1P68134 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms