Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps17P63276 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps17P63276 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps17P63276 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps17P63276 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps17P63276 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps17P63276 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps17P63276 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms