Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barhl1P63157 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Barhl1P63157 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms