Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtnP63089 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtnP63089 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtnP63089 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtnP63089 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtnP63089 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtnP63089 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtnP63089 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtnP63089 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtnP63089 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtnP63089 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtnP63089 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtnP63089 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtnP63089 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtnP63089 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtnP63089 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtnP63089 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtnP63089 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtnP63089 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtnP63089 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtnP63089 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtnP63089 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtnP63089 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtnP63089 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtnP63089 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtnP63089 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtnP63089 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtnP63089 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtnP63089 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtnP63089 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtnP63089 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtnP63089 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms