Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps3P62908 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rps3P62908 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rps3P62908 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms