Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps28P62858 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps28P62858 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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