Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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