Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rps29P62274 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps29P62274 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rps29P62274 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rps29P62274 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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