Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps18P62270 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps18P62270 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps18P62270 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps18P62270 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps18P62270 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps18P62270 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms