Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan5P62080 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms