Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ufm1P61961 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms