Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psme3P61290 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme3P61290 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme3P61290 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme3P61290 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psme3P61290 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms