Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rin3P59729 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rin3P59729 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rin3P59729 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms