Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b6P59708 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms