Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhbdl3P58873 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms