Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P58686 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P58686 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P58686 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P58686 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P58686 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P58686 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P58686 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P58686 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P58686 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P58686 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P58686 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P58686 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P58686 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P58686 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P58686 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P58686 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P58686 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P58686 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P58686 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P58686 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P58686 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P58686 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P58686 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P58686 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P58686 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P58686 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P58686 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P58686 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P58686 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P58686 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P58686 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P58686 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P58686 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P58686 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P58686 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P58686 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P58686 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P58686 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P58686 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P58686 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P58686 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P58686 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms