Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpaP58389 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpaP58389 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpaP58389 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpaP58389 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtpaP58389 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtpaP58389 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtpaP58389 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtpaP58389 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtpaP58389 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtpaP58389 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpaP58389 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpaP58389 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpaP58389 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpaP58389 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpaP58389 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpaP58389 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpaP58389 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms