Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dpf3P58269 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dpf3P58269 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms