Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpdl3bP58242 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpdl3bP58242 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms