Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Snrpa1P57784 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpa1P57784 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms