Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp25P57080 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms