Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn18P56857 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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